Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms