Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRPF18Q99633 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRPF18Q99633 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms