Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms