Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNN2Q99439 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNN2Q99439 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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