Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB3IPQ96QF0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms