Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms