Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHFRQ96EP1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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