Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms