Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EME1Q96AY2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms