Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms