Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms