Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms