Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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