Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CSNK2A3Q8NEV1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CSNK2A3Q8NEV1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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