Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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