Protein–RNA interactions for Protein: Q8N386

LRRC25, Leucine-rich repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25Q8N386 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC25Q8N386 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms