Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINGO4Q6UY18 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms