Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms