Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A4Q6P1M0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms