Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms