Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPL39P5Q59GN2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPL39P5Q59GN2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms