Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms