Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms