Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms