Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms