Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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COL24A1Q17RW2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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