Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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