Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCSK7Q16549 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms