Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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