Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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