Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A5Q15758 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms