Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms