Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCF4Q15080 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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