Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms