Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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