Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNIP1Q15025 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms