Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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NFIXQ14938 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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