Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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