Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTR4Q13639 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms