Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB31Q13636 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB31Q13636 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms