Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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