Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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TCIRG1Q13488 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
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TCIRG1Q13488 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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TCIRG1Q13488 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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TCIRG1Q13488 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCIRG1Q13488 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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