Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms