Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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