Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms