Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms