Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms