Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTBQ06643 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBQ06643 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms