Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD51Q06609 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms