Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEUP1Q05D60 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEUP1Q05D60 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms